Desde 1978, este Programa es un espacio para la reflexión y la construcción de conocimiento sobre los procesos históricos de la región. Desde 1984 adquirió carácter centroamericano al ser reconocido como tal por la Confederación Universitaria Centroamericana.

Misión: Formar profesionales, docentes e investigadores capaces de desarrollar una perspectiva crítica sobre los problemas actuales, sus raíces en el mundo global y sus múltiples proyecciones hacia el futuro y hacia el pasado.

Su estrecha relación con el Centro de Investigaciones Históricas de América Central y un equipo docente formado en prestigiosas universidades del mundo garantizan una formación de alta calidad y posibilidades de investigación con resultados excelentes, como lo evidencian las publicaciones y los premios recibidos por algunas de ellas.